المكتبة هي منار العلم والمعرفة والتى هى زاد الطلاب والباحثين في كل مكان . وتضم مكتبة المعهد ما يلي :

1-     كتب ومراجع علمية عربية وأجنبية في مجالات بيئية متعددة في التخصصات المختلفة .

2-     دوريات علمية في المجالات البيئية البحثية .

3-     مجلات وصحف .

4-     رسائل علمية ( ماجستير – دكتوراه ) .

5-     إصدارات بعض الهيئات والمؤسسات العلمية والبحثية .

6-     وثائق المؤتمرات والندوات المحلية والعالمية